随着双边或多边FTA的日益扩散，传统知识的保护问题也日渐突出，仅在2011年已签署的双边FTA中就有4个规定了传统知识的保护问题。
1）EFTA - 哥伦比亚和EFTA - 秘鲁（2011年7月1日 生效）
相关条款：第6条第5款---关于生物多样性的措施
主要内容：
- （1）各成员方强调各自对于自然资源的主权，认识到《生物多样性公约》下各自的权利和职责。公平、公正地利用遗传资源分享利益。
- （2）各成员方认识到生物多样性和相关传统知识的重要性和价值，各成员方依据现有的国内法和国际法基本原则和条款决定遗传资源的准入条件。
- （3）各成员方认识到过去、现在和将来传统知识对于国内文化、经济和社会发展的贡献。
- （4）各成员发在发明和实践中要在不符合保护遗传资源和传统知识的相关法律条款的案例中相互协作。
- （5）根据各成员国的国内法，各成员方应该要求专利申请人的文件中公布利用遗传资源的起源或者来源，在立法上实现传统知识持有者的事先知情同意权。
- （6）各成员方在国内立法上要定立行政、民事、刑事上的，针对专利申请材料中恶意或误导性的公布遗传资源来源的申请人的惩罚条款。法官要据此作出惩罚性审判。
- （7）各成员方在立法、行政措施和政策制定上，要以方便和实现遗传资源准入为目的。
- （8）各成员方要采取立法、行政和政策措施确保传统知识利用领域公平、平等的利益分享。这样的利益共享要建立在平等协商的基础之上。
2）欧盟-韩国（2011年7月1日 生效）
相关条款：第10条第40款--- 遗传资源、传统知识和民间文学艺术
主要内容：
- （1）各成员方在立法上，各成员方要尊重、保护和维护知识、发明以及实践中的传统知识。在获得知识、发明以及实践持有者的参与和统一的基础上，加强生物多样性更广泛的利用。
- （2）各成员方在以下几方面要加强信息和资源共享：（a）WIPO中建立关于遗传资源、传统知识和民间文学艺术的政府间委员会的框架构建；(b)WTO谈判中，涉及TRIPS协议和CBD协议中保护传统知识和民间文学艺术的事项；(c)CBD中，建立遗传资源的国际化市场准入机制和利益共享。
- （3）各成员方定期进行多边交流讨论，贸易委员会对多边讨论的结论进行审核，并采取任何有效的措施让审核结果生效。
3）秘鲁-韩国（2011年7月1日 生效）
相关条款：第17条第5款---遗传资源和传统知识
主要内容：
- （1）各成员方要熟知2001年10月14日WTO部长会议宣言第19段中的内容。该段是对于TRIPS协议以及CBD中关于保护遗传资源、传统知识和民间文学艺术作品之间关系的规定。
- （2）各成员方认识到生物多样性和传统知识在认知、发明和实践中的价值和作用，以及生物多样性保护性和可持续的利用。各成员方应该在国内立法，同时努力创造条件便利遗传资源在环保上利用的透明度。
- （3）立足于国内立法和CBD的规定，各成员方应该在生物多样性有更广泛的利用，同时要保证这些知识、发明和实践的持有者的同意和参与。
- （4）各成员方应当努力寻找机会去建立基于遗传资源和传统知识的专利申请的信息共享：（a）建立包含相关信息的大众资料库；（b）申请材料的书写上对原始来源有权威的、合适的检索机制。
- （5）各成员方要对WIPO政府间针对遗传资源、传统知识和民间文学艺术的讨论进行交流和信息共享。建立WTO中的TRIPS协议会议中涉及遗传资源和传统知识的论坛 。
- （6）在遗传资源的未来发展方面，各成员方要协商一致或者进行各自的国内立法。