巴拿马的土著群体对于联合国对于“减少发展中国家毁林和森林退化所致排放量”（ Reducing Emissions from Deforestation and Degradation，以下简称“REDD”）的实施问题产生了争议。巴拿马土著居民协调人代表土著团体表示，联合国没有履行REDD开始阶段的几个承诺，包括没有提供179万美元用于相关活动的资金等。这个问题反映出了REDD实施的风险和复杂性，特别是该项目可能会使长久以来的作为森林协调人的土著团体丧失对森林的权利。
巴拿马土著居民协调人负责人Betanio Chiquida说“巴拿马土著居民协调人是一个特别的组织，是中部美洲甚至整个拉丁美洲唯一的联合整个国家土著居民的组织。”该组织与巴拿马土著居民的传统权力组织合作，并代表土著居民利益与巴拿马政府合作。
根据2000年的人口普查，巴拿马大约有25万土著居民，占总人口的5%。但他们同时占据着巴拿马22%的领土，此外还有9%的领土是土著与非土著混居，因此土著居民是巴拿马土地问题的关键。
Chiquida说：“当我们谈论REDD时，不可避免的会涉及土著居民的土地。”1992至2008年间，土著区域的森林几乎没有变化。与此同时，巴拿马政府或私人所有的土地上的森林都遭到了破坏。
联合国并不否认土著团体是REDD在巴拿马或其他地方实施的重要角色，他们将巴拿马土著居民协调人称为谈判的“关键角色”。
土著团体表示联合国承诺向巴拿马土著居民协调人支付179万美元作为巴拿马REDD项目战略计划资金，但联合国最近又对此做出了拒绝。无论怎样，巴拿马土著居民协调人希望从联合国获得资金和其他支持，但如果联合国不能实现诺言，他们只能认输。
在向联合国发的信函中，巴拿马土著居民协调人写道“因为缺乏资金支持，我们已经在2012年初失去了办公场所和授薪技术员工，并推迟实施组织的各项战略计划。”在信函的最后，该组织警告“如果联合国迟迟不履行诺言支付资金，我们将正式的最终撤回之前与联合国、巴拿马政府三方达成但尚未签字的关于REDD在巴拿马实施的协议。”
作为对该信函的回应，联合国REDD项目组建议召开一次会议以消除争议。联合国承认“由于多种因素，包括一些不在联合国机构掌控范围中的因素，很多项目、包括土著团体在内受到了影响，但我们仍希望继续与巴拿马土著居民协调人的合作。”
但是，巨大的差异依然存在。联合国在回信中表示没有证据显示联合国承诺向巴拿马土著居民协调人支付179万美元。并表示做出这项承诺的联合国发展项目地区中心顾问Vanessa Retana当初的表述是“具体数字由双方在今后协商确定”。
另一个障碍在于，因为巴拿马土著居民协调人的独特结构以及法律地位的缺乏，项目进程被推迟和延长。目前，该组织并不符合接受联合国资金支持的法律要求。联合国表示其的确已经向巴拿马土著居民协调人支付过35,000美元，尽管这只还不足179万美元的2%。
双方的争议显然并不只限于资金。全世界的土著团体都担心他们是否会因REDD计划受到损失，就像他们过去在许多国内国际项目中遭受的那样。联合国希望土著团体参与到这个项目中来。但巴拿马政府及巴拿马土著居民协调人目前对于REDD计划信任不足。
Chiquida表示，政府应当“停止谈话而开始与土著居民手挽手的合作，确保那些尚未获得承认的土著区域的法律地位。”
如果实施的当，REDD将不仅仅有益于雨林保护，还将为全球数百个土著群体带来收入来源。Chiquida说“REDD将为土著居民带来显著的社会和环境效益，或者为土著区域带来严重的法律安全风险。”
没有人认为在全世界范围内实施REDD项目会使轻松的，但目前该项目实施面临的形势非常严峻。由于全世界的精力都集中在应对经济危机上，没有足够资金投入到气候和环境方面，发达国家承诺的资金支持并没有兑现，使REDD项目陷入延迟、同时，雨林数量在进一步减少，土著团体也在期待着在保护森林中起到应有的作用。